故事的舞台是互联网(♿)系统发达的都市(🏏)「DEN CITY」。在那里(🕍)有经由巨型(😦)企业「SOL技术社」通过高度的网络技术构(🦔)筑而成的被称为「LINK VRAINS」的VR空间。人们都在那个VR空间中为体验到全新(🍰)的决(🥕)斗(🏛)而狂热。可是在(✋)「LINK VRAINS」中却出现(🛺)了(🤳)利用决斗来进行(🧡)黑客行为的谜之黑客集团「海(🍋)诺因(⏩)骑士团」。而他们的目(🌙)标是将存在于互联网的某处的“AI们的世界=电子界”毁灭。然而在世界受到这样的威胁时，有一名决斗(🥨)者站了(😫)出来。而(😧)他的名字正是「Playmaker」。在那场传奇的战斗中，「Playmaker」使用压倒性的决斗将「海诺因骑士团」(🔡)打倒，成功捕获了「SOL技术社」和「海诺因骑士(🚖)团」都想要(🥠)得手的迷之AI程序。一度(🖲)拯救了世(♐)界，然后却突然(🚠)消声匿(🥫)迹了，而他的名字就在互(🗳)联(⬛)网的世界中一瞬间变得声名远(🔜)播，成为了传(🐼)说。而现在，作为「Playmaker」的正体(🔄)的某位高中(🐲)生(👛)藤木游作，为了寻找过去发生的某(😨)件事件的(😿)真相，对再次在「VRAINS」出现的「海诺因(💨)骑士团」展(💽)开了追(🧝)击(😮)......  以此为契机，命运(🗄)的齿轮就此转动……迷之AI的真身，「海诺因骑士团」盯(🏭)上「Link Vrains」的目的，以及隐藏在游作过去的真相到底是———所有(🗯)的答案，都在「Link Vrains」中