故事的舞台是互联网(👥)系统(⛑)发达的都市「DEN CITY」。在那(👈)里(🌮)有经由巨型企业「SOL技术社」(🎡)通过高度的网络技术构筑而(🅱)成的被称为「LINK VRAINS」的VR空间。人们都在那个VR空间(👎)中为体验到全新的(🅾)决斗而狂热。可是在(🐾)「LINK VRAINS」中却出现了利用决斗(🈂)来进行黑客行为的谜(⛅)之黑客集团「海诺因骑士(🐘)团」。而他们的目标是将存在(🛣)于互联网的某处(📺)的“AI们的世界=电子界”毁灭(📘)。然而在世界受到这样的(🧚)威胁时，有一名决斗者站了出来。而他的名字正(💑)是「(🥠)Playmaker」。在那(🛀)场(✝)传(🆓)奇的战斗中(🌄)，「Playmaker」使用压倒性的决斗将「(📂)海诺因(⛰)骑士团」打倒，成功捕获了「SOL技术社」和「海诺因骑士团」都想要得手的迷之AI程序。一度拯救(💈)了(🍄)世界，然(🏩)后却突然消声匿迹了，而(📦)他的名(⛰)字就在互联网的世界中一(🔛)瞬间变得声名远播(🏇)，成为了传说。而现在，作为「Playmaker」的正体(🌬)的某位高中生藤木(🌶)游作，为了寻(🍣)找过去(👏)发生的(🚤)某件事件的真相，对再次(🐙)在「VRAINS」出现的「海诺因骑士团」展开了追击(🤷)......  以此为契机，命运的(🕑)齿轮(🗾)就此转动……迷之AI的真身，「海诺因骑士团」盯上「Link Vrains」的目的，以及隐藏在游作过去的真相到底是——(🔺)—所有的答案，都在「Link Vrains」中