故事的舞台是互联网系统发达的都市「DEN CITY」。在那里有经由巨型企(👳)业「SOL技术社」通过高(❤)度的(🚅)网络技术(🍉)构筑(🍕)而成的被称为「LINK VRAINS」的VR空间(🦑)。人们都在那个VR空间中为体验到全新的决斗而狂热。可是在(💃)「LINK VRAINS」中却出现了利用(🔄)决(📟)斗来进行黑客行(🔯)为的(🍐)谜之黑客集团「海诺因骑士团(🆑)」。而(🏳)他们的目标是将存在于互联网的某(😏)处的“AI们的(🏝)世(⭐)界(🌺)=电子界”毁灭。然而(🎓)在世界受(🐥)到这样的威(🎅)胁时，有一名决斗者站了出来。而他的名字正是「Playmaker」。在那场传奇的战斗中，「Playmaker」使用压倒性的决斗将(🐧)「海诺因骑士团」打倒，成功捕获了「SOL技术社」和「海诺因骑士团」都想要得手的迷之AI程序。一(🐻)度拯救了(🔒)世界，然后却突然消声匿迹了，而他的名字就在互联网的世界中一瞬间(♑)变得(🌘)声名远播，成为(🍂)了传说。而(🍣)现在，作为「Playmaker」(🍆)的正体的某位高中生藤木游作，为了寻找过去(🛣)发生的某件事件的真相，对再次在「VRAINS」出现的「海诺因骑士团」展开了追击......  以此为契(🔕)机，命运的齿轮就此转动……迷之AI的真(🍹)身，「海诺因骑(🌄)士(💜)团」盯上「Link Vrains」的目的，以及(🔮)隐藏在游作(🗂)过去的真相到底(⛏)是——(🧤)—所有的(♊)答案，都在(🕎)「Link Vrains」(🔬)中