故事的舞台是互联网系统发达的都市(⛽)「DEN CITY」。在那里有经由巨型企业「SOL技术社」通过高度的网络技术构筑而成的被称(⚡)为「LINK VRAINS」(㊙)的VR空间。人们都在那个VR空间中为体(🎟)验到全新的决(🛢)斗而狂热(🔙)。可是在「LINK VRAINS」中却出(💇)现了利用决斗来进行黑客行为的谜之黑客集团(👗)「海诺因骑士团(🐖)」。而他(🌦)们的目标是将存在于互联网的某(😖)处的“AI们的世界=电(😉)子界”毁灭。然而(⛪)在世(💡)界受到这样的威胁时，有一名决斗者站(🤫)了出来。而他(🎃)的名字正是(🐰)「Playmaker」。在(📼)那(🀄)场传奇的战斗中，「Playmaker」使用压倒性的决(🎃)斗将「海诺因骑士团」打倒，成功捕获了「SOL技术(🚗)社」和「海诺因骑(🐧)士(🕘)团」(🚱)都想(🎎)要得手的迷之AI程序。一度拯救了世界，然后却突然消声(🌟)匿迹了，而他的名字就在(📹)互联网(🎶)的世界中一瞬间变得(😀)声名远播，成为了传说。而现在，作为「Playmaker」的正体的(🚘)某位高中生(🌴)藤木游作，为了寻找过去发生的某(🕡)件事件(🍴)的(🎚)真相，对再(🍕)次在「VRAINS」出现的「海诺因骑士团」展开了追击......  以此为契机，命运的齿轮就此转动……(👥)迷之AI的真身，「海诺因骑士团」盯上「Link Vrains」的目的，以及隐藏在游(🏥)作(✴)过去的真相到底(🤼)是———(🕗)所(❕)有的答案，都在「Link Vrains」中