故事的舞台是互联网系统发达的都市「DEN CITY」。在那里有经由(🚽)巨型(🌜)企业「SOL技术社」通过高度的网络(🛋)技术构筑(🐵)而成的被称为「LINK VRAINS」的VR空间。人们都在那个VR空间中为体验到全新的决斗而狂热。可是在「(🏦)LINK VRAINS」(🍌)中却出现了利用决斗(😿)来进行黑客行为的谜之黑客集团「海(🐬)诺因(🚈)骑士团」。而他们的目标是将存在于互联网的某处的“AI们的世界=电子界”毁灭。然而在世界受到这样的威胁时，有一(🈳)名决斗者站了出来。而(💯)他的名(👱)字正是「(🆗)Playmaker」。在(🗃)那场传(🥛)奇的战(🚐)斗中，「Playmaker」(🍅)使用压倒性的(✂)决斗将「(🎮)海诺因骑士团」打(🧜)倒，成功捕获了「SOL技术社」和「海诺因骑士团」都想要得手的迷之AI程序。一度拯救了世界，然(🅾)后却突然消声匿迹了，而他的名字就在(🈁)互联(📀)网的世(🛥)界中一瞬间变得声名远播，成为了传说。而现在，作为(🛹)「Playmaker」的正体(🛂)的某位高中生藤木(🎂)游作，为了寻(🚬)找过去发(🎃)生的某件(⛴)事件的真相，对再次在「(🏇)VRAINS」出现的「(🧣)海诺因骑士团」展开了追击......  (📏)以此为契机，命运的齿轮就此转动……迷之AI的真身，「海诺因骑士(📇)团」盯上(😠)「Link Vrains」(🕦)的目的，以(👽)及隐藏在(🐴)游作过去(💚)的真相到底(🐆)是—(🐡)——所有的答(😆)案，都在「Link Vrains」中