故事的舞台(🤒)是互联网系统发达的都市「DEN CITY」。在那里有经由巨(🏅)型企业「SOL技术社」通过(🧠)高度(🔅)的网络技术构筑(🌨)而成的被称(⛎)为「LINK VRAINS」的VR空间。人们都在那个VR空间中为体(🕚)验到全新的决斗而狂热。可(⏰)是在「LINK VRAINS」中却出现了利用决斗来进行黑客行为的谜之黑客集团「(🔷)海诺因骑士(🐰)团」(🚳)。而他们的目标是将存在于互联网的某处的“AI们的世界=电(🎟)子界”毁灭。然而在世界受到这样的威胁时，有一名(👬)决斗者站了出(🚋)来。而他(😵)的名字正是「Playmaker」。在那场传(💝)奇的战斗中，「Playmaker」使用压倒性的决斗将「海诺(💞)因(📳)骑士团」打倒，成功(🖕)捕获了「SOL技术(✔)社」和「海诺因骑士团」都(🌸)想要得手的迷之AI程(🍑)序。一度拯救了世界，然后却(📼)突然消声匿迹了，而他的名字就在(💻)互联网的世界中一瞬间变得声名(🧝)远播，成为了传(🚒)说。而现在，作(💽)为(🎴)「Playmaker」的正体的(♌)某位高(🍩)中生藤木游作，为了(🚮)寻(🥌)找过去发生的某件事件(🕟)的真相(👿)，对再次在(🔰)「VRAINS」出现的「海诺因骑士团」展开了追击......  以此为契机，命运的齿轮就此转动(🏛)……迷之AI的真身，「海诺因骑士(➕)团」盯上「Link Vrains」的目的，以及隐(📺)藏在游作(💒)过去的真相到底是(🦏)———所有的答案，都在「Link Vrains」中