故事的舞台是互联网系统发达的(📚)都市「DEN CITY」。在那里有经由巨型企业「SOL技术社」通过高度的网络(🦌)技术构筑而成的被(㊗)称为「LINK VRAINS」的VR空间。人(🏆)们都(🎻)在那个VR空间中(🎋)为体(🌩)验到全新的决斗而狂热。可是在「LINK VRAINS」中却出现了利(😽)用决斗来进行黑客行为的谜之(🔏)黑客集团「海诺因骑(🏅)士团」。而他们的目标是将(🌹)存在于互联网的(📫)某处(🍗)的(😊)“AI们的世界=电子界”毁灭。然而在世界受到这(🎚)样的威胁时，有一名决斗者站了出来。而他的名字正(💵)是(😅)「Playmaker」。在那场传奇的战斗中，「Playmaker」使用压倒性的决(🐼)斗将「海诺因骑士团」打(😸)倒，成功捕(❇)获了「(🚄)SOL技术社(💡)」和「海诺因骑士团」都想要(🚑)得手的迷之(🥐)AI程序。一度拯救了世界，然后却突然消声匿迹了，而他(🕖)的名字就在互联网的世界中一瞬间(🕘)变得声名远播，成为了(📈)传说。而(⏱)现在，作为「Playmaker」的正体的某位高中(🔩)生藤木游作，为了寻找过去发生(🕡)的某件事件的真相，对再次在「VRAINS」(💖)出现的「海诺因(🏻)骑士团」展开了追击......  以此为契(🏭)机，命运的齿轮就此转动(🎀)……(🌿)迷之AI的真身，「海诺因骑士团」盯上「Link Vrains」的目(🙁)的，以及隐藏在游作(🏩)过去的真相(🚍)到底是———所有的答案，都在「(🐔)Link Vrains」中