故事的(💔)舞台是互联网系统发达的都市「DEN CITY」。在那里有经(🌒)由巨型企业「SOL技术社」通过高度的(🥅)网络技术构筑而成的(🥏)被称为「LINK VRAINS」的(🌿)VR空间。人(🥢)们都在那个VR空间中为体验到全(🍅)新的决斗而狂热。可是(🧘)在「LINK VRAINS」中却出现(💆)了利用决斗来进行(🧦)黑(🕐)客行为的(✴)谜之黑客集团「海诺(🐮)因骑士团」。而(💘)他们的目标是将存在(👖)于互(👀)联网的某处(🍮)的“AI们的世界=电子界”毁灭。然而在世界受到这(🗽)样(⭐)的威胁时，有一名决斗者站了出来。而他的名字正是「Playmaker」。在那场传奇的(📉)战斗中，「Playmaker」使用压倒性的决斗将「海诺因骑士团」(🎗)打倒，成功捕获了「SOL技术社」和「海(👛)诺因骑士(😶)团」都想要得手的迷之AI程序。一(🍰)度拯救了世界(🐒)，然后却突然消(🍀)声匿迹了，而他的名字就在互(🕛)联网(🚎)的世界中一(😵)瞬间变得声名远(🙈)播，成为了传说。而现在，作为「Playmaker」的正体的某位高中生藤木游作，为了寻找过去发生的某件事件的真相(👚)，对再次在「VRAINS」出现的「海诺因骑士团」展(🗾)开了追击......  (🐞)以此为契机(🍐)，命运的齿轮就此转动……迷之(👽)AI的(⏰)真身，「(⬅)海诺因(💯)骑士团」盯上「(🌓)Link Vrains」的目的，以及隐藏在游作过去的真相到底是———所有的答案(🦐)，都在(🏐)「Link Vrains」中