故事的舞台是互联网系(💗)统发达(📮)的都市「DEN CITY」。在那里有经由巨型企业(🗺)「SOL技术社」通过高度(👱)的网络技术构筑而成的被称为「LINK VRAINS」的VR空间。人们(📗)都在那个VR空间(🌆)中为体(🔳)验到全新的决斗而狂热(😢)。可是在「LINK VRAINS」中却出现了利用决斗(🎞)来进行黑客(🕣)行为的谜之黑客(😟)集团(🚓)「海诺因骑士团」。而他们的目标是将存在于互联网的某处的(🍅)“AI们的世界=电子界”毁灭。然而在世界受到这(㊗)样的威(♏)胁时，有(🏁)一名决斗者站了出来。而(🕖)他的名字正是「Playmaker」。在那场传奇的战斗中，「Playmaker」使用压倒性的(🙇)决斗将「(🐇)海诺因骑士团」打倒，成功捕获了「(🐟)SOL技(🕉)术(👢)社」和「海(🈚)诺因骑士(🌲)团」都想要得手的迷之AI程序。一度拯救了世界，然后却突然消声匿迹了，而他的名字就在(🌧)互(♿)联网的世界中一瞬间变得声名远(🎣)播，成为(👏)了传(🆘)说。而现在(🔧)，作(📇)为「Playmaker」的正体的某位(📞)高中生藤木游(🌬)作，为了寻找过去发生的某件事件的真相，对再次在「VRAINS」(🍕)出现的「海诺因(🍁)骑士团」展开了追击......  以此为契(🌏)机，命运(🦆)的齿轮就此转动……迷之AI的(🌆)真(🤷)身，「海诺因骑士团」盯上「Link Vrains」的(⏪)目的，以及隐藏在游作(🕷)过去的真相到底是———所有的答案，都在「(💴)Link Vrains」中