故事的舞台是互联网系统发达的都市「(👯)DEN CITY」。在那里有经由巨型企业「SOL技术(💼)社」(🤮)通过高(😲)度的网络(🚗)技(😷)术构筑而成的被称为「LINK VRAINS」的VR空间(🏔)。人们都在那(🕳)个VR空(🎒)间中为体验到全新的决斗而狂热。可是(🎲)在「LINK VRAINS」中却出现了(🕵)利用(🔂)决斗来进行黑客(😆)行为的谜之黑客(🈯)集团「海诺因骑士团」。而他(🥠)们的目标是将存在于互联网的某处的“AI们的世界=电子界”毁灭(🆑)。然而在世界受到这样的威胁时，有一名决斗者站了出来(🧝)。而他的名字正是「Playmaker」。在那场传奇(🍃)的战斗中，「Playmaker」使用压倒性的决斗将「海诺因骑(🚙)士团」(📱)打倒，成(🤫)功捕获了「SOL技术社」和「海诺(🛐)因骑士团」都想要得手的迷之AI程序。一度拯救(🦉)了世界，然后却突然消声匿(🛳)迹了，而他的名字(💔)就(💨)在(😘)互联(😗)网的世界中(🦐)一瞬间变得声名远(🈁)播，成为了传(👸)说。而现在，作为「Playmaker」的正体(🐇)的某位高中生藤木游作，为了(🐶)寻找过去发生的某件事件(😿)的真相，对再次在「VRAINS」出现的「海诺因(🔳)骑士团」展开了追击(👸)......  以此为契机，命运的齿轮就此转动……迷之AI的(Ⓜ)真身，「海诺因骑士团(🧞)」盯上「Link Vrains」(🍷)的目的，以及隐藏在游作过去的(🐽)真相到底是———所有的答案(💪)，都在「(📻)Link Vrains」中