故事的舞台是互联网系统发达的都市「(🏙)DEN CITY」。在(💗)那里有经由巨型企业「SOL技术社」通过高度的网络技术构筑而成的被称为(㊙)「LINK VRAINS」(🍈)的VR空间。人们都在那(🦃)个(🌤)VR空间中为体(😜)验到全新的决斗而狂热。可(😶)是在(🐋)「LINK VRAINS」中却出现了利用决斗来(🈵)进行黑客行(🤫)为的谜之黑(🕍)客集团「海诺因骑士团」。而他们的目标是将存在(🍯)于互联网的(🐕)某处的“AI们的世界=电子界”毁灭。然而在世界受(🏌)到这样的威胁时，有一名决斗者站了出来。而(🧖)他的名字(🥝)正是「Playmaker」。在那场(👘)传奇的战斗中，「Playmaker」使用压倒性的决斗将「海诺因骑士团」打倒，成功捕(🧕)获(😹)了「SOL技术社」和「海诺因骑士团」都想要得手的迷(🚖)之(🌽)AI程(😎)序。一度拯救了世界，然后却突然(🍳)消声匿迹了，而(🛩)他的名字就在互联网的世界中一瞬间变得声名远播，成为了传说。而现(🔴)在，作为「Playmaker」的正体的某位高中生藤木游作，为(📯)了寻找过去发生的某件事件的真相，对再次在「VRAINS」出现的「海诺因骑士团」展开了(🛣)追击......  (🕶)以此为契机，命运的(⛑)齿(🥒)轮就此(🐙)转动…(🚶)…迷之AI的真身，「(😌)海诺因(🚡)骑士团」盯上「Link Vrains」的目(📚)的，以及隐藏在游作过去的真相到底是——(🕤)—所有的答案(📍)，都在「Link Vrains」中