故事的舞台是互联网系统发达的都市「DEN CITY」。在那里(⭕)有经由巨型企业「(🤜)SOL技术社」通过高(🥅)度的网络技术构筑(🧕)而成的被称为「LINK VRAINS」的(🍉)VR空间。人们都在那个VR空间(🔻)中为体验到全新的决斗而狂热。可是在「LINK VRAINS」中却出现了利用决斗来进行黑(🏡)客行为的谜之黑客集团「(🐬)海诺因骑(🦒)士团」。而他们的(🎤)目(👷)标是将存在(⚽)于互(✡)联网的某处的“AI们的世界(🍟)=电(📦)子界”毁灭。然而在世(📝)界受到这样的威胁时，有一(🥪)名决斗者(🐞)站了出来。而他的名字正是「Playmaker」。在那场传奇的战斗中，「Playmaker」(🦂)使用压倒性的决斗将「海(😼)诺因(🔟)骑士团」打(⏮)倒，成功捕获了「SOL技术社(🤰)」和(🆑)「海诺因骑士团」都想要得手的迷之(🔅)AI程序。一度拯救了世界，然后却突然消(📄)声匿迹了，而他的名字就在互联网的世(🛋)界中一瞬间变得(🈁)声(💰)名远播，成为了传说。而现(❓)在，作为「Playmaker」的正体(🐯)的某位高中生藤木游作(❣)，为了寻(🆎)找过去发生的某件事件的真相，对再次在「VRAINS」出现的「海诺因骑士(🌜)团」展开了(😼)追击......  以此为(🔎)契机(🐋)，命运的齿轮就此转动……迷之AI的真身，「海(🦐)诺因骑士团」盯上「Link Vrains」(🌇)的目的，以及隐藏在游作过去的真相到底是———所有的答(🆎)案(🚢)，都(🎱)在「Link Vrains」(🛌)中