故(👦)事的舞台是互联网系统发达的都市「DEN CITY」。在那里有经由巨型企业「SOL技术社」通过高度的网(🌠)络技术构筑而成的被称为(⏭)「LINK VRAINS」的VR空间。人们(⛷)都在(💩)那个VR空间中为体验到全新的(🍎)决斗而狂热。可是在「LINK VRAINS」中却出现了利用决斗(🏏)来进行(👣)黑客行为的谜之黑客集团「海诺因骑士团(👠)」。而他(😠)们的目标是将(🐯)存在(🐤)于互联网的某处的(🐽)“AI们(💁)的世界=电子界”毁灭。然而在世界受到这样的威(🧗)胁时，有一名决斗者站了出来。而他(😘)的名字(🕐)正是「Playmaker」(🍕)。在那场传奇的战斗中，「Playmaker」使用压倒性的决斗将「海诺因骑士团」打倒，成功捕获了「SOL技(🚿)术社」(👦)和「海诺因骑士(🌷)团」都想要得手的迷之AI程序。一(🌽)度拯救了世界，然后却突然消(🍣)声匿迹了，而他的名字就(🥫)在互联网(🌁)的世(👟)界中一瞬间变得声名远播，成为了传说。而现在，作为「Playmaker」的正体的某位高中生藤木游作，为了寻找过去发生(🏟)的某件事件的真相(💍)，对再次在「VRAINS」出(🧤)现的「(🦁)海诺因骑士团」展开了追击......  以此为契机，命运的齿(🚖)轮就此转动…(🤑)…迷之AI的真身，「海(💋)诺(🛺)因骑士团」盯上「Link Vrains」的(🥄)目的，以及隐藏在游作过(⬆)去的真相到底是———所有(🈲)的(🕶)答案，都在「Link Vrains」中