故事的(📅)舞台是互联网系统发达的都市「DEN CITY」。在那里有经由巨型企业「SOL技术社」通过(🌤)高(⏪)度的网络技术构筑而成的被称为「LINK VRAINS」的VR空(👾)间。人们都在那个VR空间中为(💔)体验到全新的决斗而狂热。可是在「LINK VRAINS」中却出现了利用决斗来进行黑客(🍚)行(👲)为的谜之黑客集团「海(😾)诺因骑士团」。而他们的(🗨)目标是将存在于互联网的某处的“AI们的世界=电子界”毁灭。然而在(🤢)世(🗣)界受到(💯)这样的威(👶)胁时，有一名决斗者站了(🛠)出来。而他的名字正是「Playmaker」。在(🥃)那场传奇的战斗中，「Playmaker」使用压(🚝)倒性的决(💿)斗(📐)将「海诺因骑士团(💒)」打倒，成功捕获了「SOL技术(🦆)社」和「海诺(🗼)因骑士团」都想要得手的迷之AI程序。一度拯救了世界，然(🥀)后却突(🎗)然消声匿迹了，而他的名字(🏤)就在互联网的世界中(🤛)一瞬间变得声名(🖌)远播，成(🚦)为(🛍)了传说。而现在，作为(👔)「Playmaker」(⚾)的正体的某位高中生藤木游作，为了(🌦)寻找过去发(🐌)生的某件事件的真相，对再次在「VRAINS」出现的「海诺因骑士团」展(🆓)开了追击......  以此为契机，命运的齿轮就此(👯)转动……迷之AI的真(🧘)身(🖇)，「海诺因骑士团」盯上「Link Vrains」的目的，以及隐藏在游作过去的真相到(😐)底是———所有的答案，都在「Link Vrains」中