故事的舞台是互联网系统发达的都市「DEN CITY」(🔰)。在那里有经由巨型企业「SOL技术社」通过高度的网络技术构筑而成的被(🤵)称为「LINK VRAINS」的VR空间。人们都在那个VR空间中为体验到全新的决斗而狂(💺)热(🌻)。可(😨)是在「LINK VRAINS」中却出现了利用决斗来进行黑(🥩)客行为的谜(🐴)之黑客集团「海诺因骑士(📠)团」。而(🐟)他们(🎡)的目(🕯)标是(🚥)将存在于互联网的某处的“AI们(🔷)的世界=电子界”毁灭。然而在世界受到这(📱)样的威胁时，有一名决斗者站了出来。而他的名字正是「Playmaker」。在那场传奇的战(📰)斗中，「Playmaker」使用压倒性的决斗将「(📟)海诺因骑士团」打倒，成功捕获了(🌴)「SOL技(🤳)术社」和「海(🥄)诺因骑士团」都想要得手的迷之AI程序。一度拯救了(⬅)世界，然后(👂)却突然消(🍯)声(🍵)匿迹了，而他的名字(🛂)就在互联网的世界中一瞬间(👨)变得声名远播，成为了传说。而现在，作为「Playmaker」的正(🧗)体的某位高(😡)中(🌔)生藤木游作，为了寻找过去发生的某件事件的真相，对再次在「VRAINS」出现的(📷)「海诺因(🙌)骑士团」展开了追击......  以(🌆)此为契机，命运(📱)的齿轮就此转动……迷之(🥇)AI的真身，「海诺(📂)因骑士团」盯上「Link Vrains」的目的，以及隐藏(🤺)在游作过去的真相(😾)到(🔗)底是———所有的答案，都在「Link Vrains」中