故事的舞台是互联网系统发达的都市「DEN CITY」。在那里有经由巨型企业(💾)「SOL技术社(🚴)」通(📂)过高(🤝)度的网络技术构(🖌)筑而成的(🛢)被称为「LINK VRAINS」的VR空(💣)间。人们都在那个VR空间中为体验到全新的决斗而狂热。可是在(🖍)「LINK VRAINS」中却出(🛳)现了利用决斗来进行黑客行为(🤲)的(😘)谜之黑客集团「海诺因骑士团(🥖)」。而他们的目标(🖥)是将存(💥)在于互联网的某处的“AI们的世(💜)界=电子界”毁灭。然而在世界受到这样的威胁时，有一名决斗者站(⚽)了出来。而他的名字正是「Playmaker」。在那场传奇的战斗中，「Playmaker」使用压(🌷)倒(🍼)性的(🍫)决(🕵)斗将「海诺因骑士团」打倒，成功捕获了「SOL技(🤷)术(🐚)社」和「(🛷)海诺因骑士(🚵)团」(🛌)都想要得手的迷之AI程序。一度拯救(🐴)了世界，然后却突然消声匿迹了，而他的名字就在互联网的世界中一瞬间(🕸)变得声名远播，成为了传说。而现(👮)在，作为(💶)「Playmaker」的正体的某位高中生藤木游(🕓)作，为(🔕)了寻找过去发(🔃)生的某件事件的真相，对再次在「VRAINS」出现的「海(🤘)诺因骑士团(🕛)」展开了追击......  以此为契机，命运的齿轮就此转动……迷之AI的真身，「海诺因(🏺)骑士(🌕)团」盯上(😎)「Link Vrains」的目的，以及隐藏在游作过去的真相到底是———所有的答案(🔃)，都在「(🌏)Link Vrains」中