故事的舞台是互联网系统发达的都市「DEN CITY」。在那里有经由巨型企业「SOL技术社」通过高度(🔻)的(🌭)网络技术构(⏹)筑而成的被称为「LINK VRAINS」的VR空间。人们都在那个VR空间中为体验到全新的决斗而狂热。可是(🎨)在(⌛)「LINK VRAINS」中却出现了利用决斗来进行(〽)黑客行为的谜之黑客集团「海诺因骑士团(🎬)」(🙉)。而他们的目标是将存在于互联网的某处的“AI们的世界=电(🕳)子界”毁灭。然而在世界受到这(🎓)样的威胁(🎟)时，有(🛄)一名决斗者站了出来。而他的名字正是「Playmaker」(💗)。在那场传(🥧)奇的战斗中(🎧)，「Playmaker」使用压倒性的决斗将(💙)「海诺因骑士团」打倒，成功捕获了「SOL技术社(🛠)」和「海诺(👌)因骑士团」都想要得手的迷之AI程(💗)序。一度拯救了世界，然(🉐)后却突然消声匿迹了，而他的名字就(🌉)在互联(🈁)网的世界中一(👳)瞬间变得声名远播，成为了传说。而现(🎨)在(👥)，作为「Playmaker」的正体的某位(🔣)高中生藤木(🛒)游作，为了寻找过(🔙)去发生的某件事件的真(🔓)相，对再次在「VRAINS」(🌯)出(🕵)现的(🎉)「海诺因骑士团」展开了追击......  以此为契机，命运的齿轮就(🧠)此转动……迷之AI的真身，「海诺因(😗)骑士团」盯(😔)上「Link Vrains」(💷)的目的(🔂)，以及隐藏在游作过去(😳)的真(🤮)相到底是———所有的答案，都在「Link Vrains」(🧟)中