故事的(⛰)舞台是互联网系统发达的都市(🍂)「DEN CITY」(🐉)。在那里有经由巨型企业(😷)「SOL技术社」通过(👖)高度的网络技术构筑而成的被称为「LINK VRAINS」的VR空间。人们都(🚜)在那个VR空间中为体验到全新的决斗而(💢)狂热(🤛)。可是在「LINK VRAINS」中却出现了利(🚿)用决斗来进行黑(🔧)客行为的谜之黑客集团(🏌)「海(👒)诺因骑士团」。而他们的目标是将存在于互联网的某处的“AI们的世界=电子界”毁灭。然而在世界受(🌗)到这样的威胁时，有一名决斗(👋)者站了出来。而他的名字正是「Playmaker」。在那场传奇的战斗中，「Playmaker」使用压倒性的决斗将「(🐀)海诺因骑士团」打倒，成功捕获了「SOL技术社」和「海(🐽)诺因骑士团」都想要得手的迷之AI程序。一度拯救(🌝)了世(🗨)界(🥤)，然后却突然消声匿迹了，而他的名字(🆘)就在互联网的世界中一瞬间变得声名远(😎)播，成为了传(🎠)说。而现在，作为(🏪)「Playmaker」的正(🤙)体的某(🌷)位高中生藤木游作，为了寻找过去发生的某件事(🐂)件的(🥁)真相，对(🐬)再次在「VRAINS」出现的「海诺(👶)因(🔢)骑士团(🐀)」展开了追击......  以(💨)此为契机，命运的齿轮就此转动……迷(😚)之(🔯)AI的(🕘)真身，「海诺因骑士团」盯(📡)上「Link Vrains」的目的，以(🗺)及隐藏在游作过去的真相到底是———所(⬅)有(🏍)的答案，都在「Link Vrains」中