故事的舞台是互联网系统(👭)发达(💸)的都市「DEN CITY」。在那里有经(🍣)由巨型企业「SOL技术社」通过高度的网络技术构筑而成的(👪)被称为「LINK VRAINS」的VR空间。人们(🔌)都在那个VR空间中为(🔧)体验到全新的决斗而狂(❎)热。可是在「LINK VRAINS」中却出现了利(⏭)用决斗来进行黑客行为的(🦏)谜之黑客集团「海诺因骑士团」。而他们的目标是将存在于互联网的某处的(🧔)“AI们的(💒)世界=电子界”毁(🕒)灭(💢)。然而在世界受到这样的威胁时，有一名决斗者站了出来。而(🏑)他的名字正是「Playmaker」。在那场传奇的战斗中，「Playmaker」使用压倒性的决(🌥)斗将「海诺因骑士团」打倒，成功捕获了「SOL技术(💤)社」(🤪)和「海诺因骑士团」(🐻)都想要得手的迷之AI程序。一度拯救了世界，然(😞)后却(🐺)突然(📭)消(📍)声匿迹了，而他的名字就在互联网的世(💱)界中一(🕳)瞬(💪)间变得声名远播，成(💦)为了传说。而现在，作为「Playmaker」的(📇)正体(🦓)的某位高中(🎊)生藤木游作，为了寻找过去发生的某件事件的真相，对再次在「VRAINS」出(🌧)现(📎)的「海诺(🕘)因骑(👘)士团」展开了追击......  以此为契机，命(😡)运的齿轮就(🕧)此转动……迷之AI的(🤔)真身(🌕)，「海诺因(👆)骑士团」盯上「Link Vrains」的目的，以及隐藏在游作过去的真相到底是——(🚸)—所(🉑)有的答案，都在「Link Vrains」(🤬)中