故事的舞(🔁)台是互联网系统发达的都(🗂)市(🌑)「DEN CITY」(🕙)。在那里有经由巨型(♊)企业「SOL技术(🖍)社」通过高(🔗)度的网络技术构筑而成的被(🎸)称为「LINK VRAINS」的VR空间。人们都在那个VR空间中为体验到全新的决斗而(🌰)狂热。可是在「LINK VRAINS」中却(🤚)出现了(🔣)利用决斗来进行黑客行为的谜(🐎)之黑客集(🏣)团「海(🏅)诺因骑士团」。而他们的目标是将存在于互联网(🌕)的某处的“AI们的世界=电子界”毁(➡)灭。然而(🍛)在世界受到这(💉)样的威胁时，有一(🐟)名决斗者站了出来。而他的名字正是(🐕)「Playmaker」。在那场传奇的战斗中，「Playmaker」使用压倒性的决斗将(🅾)「海诺因(💱)骑士团」打倒，成(😆)功捕获了「SOL技术社」和「海诺因骑士团」都想要得手的迷之AI程序。一度拯救了世界(🧘)，然后却突然消声(🌑)匿迹了，而他的名字就(🧑)在互联网的世界中一瞬间(💨)变得声名远播，成为了传说。而现在，作为「Playmaker」的正体的某位高中生(🐂)藤(👷)木游作(💄)，为了(🎸)寻找过去发生的某件事(😥)件的真相，对再次在「(💟)VRAINS」出(🥄)现的「海诺因骑士(💱)团」展开了追击......  以此为契机，命运的齿(🕗)轮(📀)就此转动……迷之AI的真身，「海诺因骑士团」盯上「Link Vrains」的目(🦓)的，以及隐(🆎)藏在游作过去的真相到底是——(❤)—所有的答案，都在「Link Vrains」中