《超级机器人大战·原创世纪》的背景是新西历，人类正式开始进出宇(🍖)宙2世纪，但因为2次大型陨石的(🌇)坠下，人们的生活还是维持在(🎠)21世纪初(🎳)。到了新西历179年，第3颗陨石“流(🙎)星3(メテオ3)”坠落于(🚻)南太平洋的マーケサズ群岛海面。地球(⏰)连邦政府(🚷)经过调查(🖨)，发现是由人类未知的技术制造(🧚)的物体，这(🥌)种地球(😍)以(🌌)外(🈲)的技术被称为EOT(Extra over technology)。地球连邦政府组成了“EOT特别审议会”和(📘)“EOTI机关”进行调查。然后EOTI机关的代表比安博士(🤱)发表了(🌇)研究结果，表示地球有被(📒)宇宙以外的生命体侵略的危机。从(💉)此，人型机动兵器：Personal Trooper的研(🛍)究开始了。